Il Progetto CCM “Metodologie di screening fenotipiche e molecolari per il rilevamento delle colonizzazioni da enterobatteri resistenti ai carbapenemi (CRE)”

Riassunto

Gli Enterobatteri resistenti ai carbapenemi (CRE) sono ritenuti a livello globale una delle principali minacce per la salute pubblica. Le linee guida nazionali e internazionali sottolineano l’importanza di politiche di sorveglianza di routine attiva per prevenire la loro trasmissione. Di conseguenza, lo screening per la valutazione dello stato di colonizzazione da CRE in pazienti ospedalizzati è considerato fondamentale per contenere e controllare la diffusione di questi microrganismi e la loro evoluzione verso un quadro di infezione. 

Il Progetto CCM–Ministero della Salute intitolato Metodologie di screening fenotipiche e molecolari per il rilevamento delle colonizzazioni da enterobatteri resistenti ai carbapenemi (CRE) si è svolto nel periodo compreso tra febbraio 2018 e gennaio 2021 con l’obiettivo di valutare i test fenotipici e molecolari quali metodi in grado di rilevare i pazienti colonizzati da CRE in ambito ospedaliero in Italia. Per valutare l’impatto della pandemia di SARS-CoV-2 sulla colonizzazione da CRE, il periodo di osservazione è stato suddiviso in due: un primo periodo che andava da settembre 2018 a settembre 2019, un secondo periodo da ottobre 2019 a settembre 2020.

Quale obiettivo generale del progetto, è stata opportunamente prevista la valutazione dell’efficacia dei metodi; al fine di acquisire ulteriori informazioni sono stati inseriti quattro obiettivi specifici: 1. confrontare i metodi fenotipici in termini di rapidità con il metodo molecolare; 2. quantificare la frequenza di colonizzazione all’ingresso e durante il ricovero nei reparti di terapia intensiva (ICU) e non ICU; 3. valutare l’efficacia degli interventi di screening; 4. prevedere attività che attestano l’importanza dello screening.

Allo studio hanno partecipato sette centri ospedalieri, dislocati in differenti Regioni, rappresentative di aree geografiche diverse: tre al Nord, una al centro e tre al Sud Italia. Sono stati arruolati 11.063 pazienti, i cui dati sono stati inseriti in una piattaforma IT dedicata. Al fine di valutare il ruolo dell’ospedalizzazione nella colonizzazione, i tamponi rettali sono stati eseguiti all’ammissione e, se negativi, settimanalmente per tre settimane.

È stata confermata la capacità del test molecolare di rilevare i pazienti colonizzati e la presenza di marcatori di resistenza entro 60 minuti dall’arrivo del campione in laboratorio. La prevalenza dei CRE è aumentata durante la pandemia causata da SARS-CoV-2, soprattutto negli ospedali del Sud. K. pneumoniae è stata la specie più frequentemente associata ai pazienti colonizzati da CRE.

Sono state avviate attività di formazione per il personale ospedaliero al fine di ridurre la frequenza di colonizzazione nei reparti. Tutti i centri partecipanti al progetto hanno definito le procedure da applicare localmente per lo screening dei pazienti colonizzati da CRE e avviato attività di screening.

 Parole chiave: epidemiologia, prevalenza in ICU e non ICU, screening CRE, test fenotipici e molecolari

Abstract

Carbapenem-resistant Enterobacterales (CREs) are globally considered to be a major threat to public health. National and international guidelines emphasize the importance of routine active surveillance policies to prevent their transmission. Consequently, screening for the evaluation of the status of colonization by CREs in hospitalized patients in Italy is considered essential to contain and control the spread of these microorganisms and their evolution towards infection. 

The Italian Ministry of Health funding the CCM Project “Phenotypic and molecular screening methodologies for the detection of colonizations due to carbapenem-resistant enterobacterales (CRE)”, carried out between February 2018 and January 2021 with the aim of evaluating phenotypic and molecular tests as methods able to detect patients colonized by CRE in Italian hospital setting. To assess the impact of the SARS-CoV-2 pandemic on CRE colonization, the observation period was divided into two periods: September 2018-September 2019 (first period) and October 2019-September 2020 (second period).

As general objective of the project, the evaluation of the effectiveness of the methods has been appropriately foreseen. In addition, four specific objectives have been envisaged: 1. to standardize and to compare phenotypic and molecular methods, in terms of Turnaround Time (TAT); 2. to quantify the frequency of colonization at the admission and during hospitalization in Intensive Care Unit (ICU) and non-ICU wards; 3. to evaluate the effectiveness of screening interventions; 4. to provide activities that attest to the importance of screening.

In order to evaluate the role of hospitalization in CRE-colonization, 11,063 patients were enrolled to perform rectal swabs on admission, and, if negative, weekly for three weeks during hospitalization. The data were collected in a dedicated IT platform.

The molecular test demonstrated to be able to detect colonized patients and presence of resistance markers within 60 minutes from the sample arriving.

The prevalence of CRE has increased during SARS-CoV-2 pandemic, especially in hospitals in South Italy. K. pneumoniae was the species most frequently associated with patients colonized by CRE.

Training activities have been started for hospital staff, in order to reduce the frequency of colonization of patients. All the participating centres have defined the procedures to be applied locally for the screening of CRE colonized patients and have started screening activities.

 Keywords: epidemiology, prevalence in ICU and non-ICU, CRE screening, phenotypic and molecular tests